而就在四川平定叛亂的戰局快要接近尾聲的時候，天啟元年六月，熊廷弼入京了。
同時緊急奉詔進京的還有先后隸任四川總督、薊遼總督的王象乾，以及剛剛平定苗疆叛亂的張鶴鳴和原山東巡撫王在晉。
遼陽沈陽相繼被后金攻破，朝廷臣請用引退賦閑在家的王象乾象乾，天啟帝特遣官齎敕，召之至京。
此時正值兵部尚書崔景榮謝事，朝廷即命王象乾代理兵部尚書一職。
王象乾倒是干脆，以七十有幾高齡，主動請纓，以年老目瞆不欲署部事，疏陳守御關外及招撫插漢諸部方略，拒絕留京掌管兵部，請求外任薊遼總督。
天啟大稱獎，正巧薊遼總督文球因病致仕，遂同意了王象乾的請求。
領旨后的王象乾于是招徠昔日舊部，急急忙忙的便出發了，去鎮守薊州！
而張鶴鳴卻是人精一個，接詔后一路托病緩行，等距離最遠的熊廷弼到任后方才緩緩來遲，卻意外留京掌管兵部。
王在晉因之前一直負責保障后勤，遂受命以任戶、工、兵三部左侍郎，一職三任，也是牛大發了。
聽聞熊廷弼即將到京，王在晉特意等了三天，等熊廷弼到后方才一起進宮面圣。
而此時的熊廷弼算是王者歸來，威望一時間達到了頂點。
熊廷弼入京之日，都人焚香誥天，兵部衙門更是被擠了個水泄不通。
當然，熊廷弼也不含糊，面圣時向天啟分析了下遼東目前的局勢：奴酋新據遼陽，根基不穩，遼人難服，要想恢復遼東，須三方布置：在廣寧厚集步騎以牽制后金主力；在天津與登、萊各設巡撫，置舟師，乘機入遼南；在山海關設經略，節制三方。
“一軍出廣寧用馬步兵對壘與三岔河，吸引后金主力，一軍以海上督舟師乘虛入南衛，只需大張旗鼓動搖敵之軍心即可，同時在東面聯合朝鮮從后方打擊后金，奴酋必然腹背返顧，奇正相倚，則恢復遼陽大有可為。登萊天津廣寧三地并設撫鎮山海適中之地經略節制三方。”
熊廷弼三方布置之策一一出，朝廷各方一片叫好，天啟也十分高興，對熊廷弼那是有求必應，加封兵部尚書，兼右副都御史，命其駐守山海關，第二次升任遼東經略，經略遼東軍務。
熊廷弼也不客氣，借此請尚方寶劍，請調兵二十余萬，以兵馬、糧草、器械之類責成戶、兵、工三部。請為監軍道臣高出、胡嘉棟，督餉郎中傅國昭雪，恢復官職，讓他們理事。建議啟用遼人原贊畫主事劉國縉為登萊招練副使，夔州同知佟卜年為登萊監軍僉事，原臨洮推官洪敷教為職方主事，軍前贊畫，用以收攏遼人的心。
此時正值用人之際，天啟稍加思緒后，便都予以批準。
昔日正三品的侍郎變成了正二品的尚書，曾經的四品僉都御史升級為三品副都御史，不但頭銜嚇人，天啟還要求在熊廷弼出京之日，大小京官出郊踐行。
熊廷弼雖是遼東經略，但朝廷也不知怎么想的，同時又擢王化貞為遼東巡撫。
王化貞此人原先只是個兵備道駐守廣寧，當時沈陽陷落，王化貞就認為奴之得志非虜所欲寄希望花錢請蒙古人起兵滅奴。