用魏廣德的話來說，明軍上島可為當地原住民帶來圣人教誨，讓他們開慧明智，乃是大功德之事。
不過，隨著大股倭寇被擊潰、殲滅，這些曾經被倭寇占據的巢穴許多都已經荒廢。
為什么這么說呢
大家應該要知道用兵能消除禍亂，但也能招致禍亂，倘若恃富逞強，好大喜功，惹是生非，就會結怨挑釁，這不恰恰招惹了禍亂
正如醫生亂開瞑眩之藥，強迫無病之人服用，雖然不至于造成身體殘疾或送命，但足以大傷元氣
所以為國當政者應該常講軍事，但千萬不能窮兵黷武”
有了這個原因，所以之前大明水師即便發現東番島上有倭寇活動的蹤跡，往往也只是快速打擊一番就立刻撤兵，并不會真正進入東番島。
朕以諸蠻夷小國，阻山越海，僻在一隅，彼不為中國患者，朕決不伐之，惟西北胡戎指漠北蒙古世為中國患，不可不謹備之耳，卿等當記所言，知朕此意。”
這是一生講究“洪武”、“尚武”的老辣皇帝的“諄諄教導”，這更是朱元璋從歷史經驗教訓中得到的頓悟。
兩月后，京城收到俞大猷的急報。
魏廣德在看完戰報后，當即以此為題寫了一份奏疏，詳盡把東番島可謂福建屏障，佑護東海安寧的作用寫出。
古人有言，地廣非久安之計，民勞乃易亂之源。
有部將開口說道。
等天下太平了，只需整修甲兵操練士卒，備作國防而已。
轉念一想，拿下東番島其實也是開疆拓土，只是有個巨大的阻礙很難克服，那就是皇明祖訓。
可就是考慮到投入和產出不匹配，大家都是流官，完全沒必要為后人做嫁衣。
現在魏廣德又支持俞大猷去拿下東番島，雖然就張居正所知，東番島上只有少量原住民，并無什么國主之類的，也就是大明可兵不血刃拿下此地，可私下里張居正詢問過福建官員，大多對此不看好。
對外，則是以兵部命令南洋水師上島剿倭為名出兵，只后在南北設立水寨，也可對外說是防止倭寇死灰復燃。
魏廣德正篇奏疏，都刻意回避了此事。
面積超過1平方公里的島嶼還有虎井、吉貝、望安等8個，其余53個島嶼的面積都在1平方公里以下，其中有44個島嶼無人居住。
直接以教諭身份招募，怕是許多人都不會愿意去，給他們五年時間換取九年考滿，回來直接安排到縣衙擔任縣令一類的官職，還是很有吸引力的。
現在朝廷采辦巨木，已經多從瓊州和西南置辦，千里迢迢，運輸也極為麻煩。
即便當初曾經遷移過百姓居住，也因此朝廷禁海，島上居民得不到大陸的補給而不得不選擇離開，回歸大明。
澎湖的開發歷史，可以追溯到秦漢以前，于宋代已正式收入中國版圖，隸屬福建省泉州府，其開發時間比臺灣本島早380余年。
也因為發現了大明對此地的忌憚，所以許多倭寇也曾經把此地作為他們的巢穴加以經營。
此番目標是澎湖，一切以消滅盤踞在澎湖的倭寇為首任。
在當下，浙江剛剛遭遇了倭寇襲擊，雖然這股倭寇即將被他們消滅，可朝廷上對此肯定也會施以雷霆手段，主要就看朝中大人們是否有取東番之心。
元、明時期，隨著移民日益增多，設置了巡檢司，不過大明對此地一直疏于管理，特別是明初倭亂，為了施行海禁，將澎湖人口遷回福建，撤銷了澎湖巡檢司。