研究疾病發生、發展、轉歸及變化等等之內在機理的學說稱病機學說。
《素問·至真要大論》所說“審察病機，無失氣宜“、“謹守病機，各司其屬“都是此學說的內容。
1.病因:引起人發病的原因很多，《黃帝內經》將其歸納為二類。風雨寒暑實為“六淫“的概括;陰陽喜怒乃“七情“的概括;飲食居處即“飲食勞倦“。可以認為這就是后世三因說之濫觴。
2.發病:正邪雙方力量的對比，決定著疾病的發生與發展，這就是“正氣存內，邪不可干“之意。《素問·上古天真論》所說“精神內守，病安從來“，《素問·評熱病論》所說“邪之所湊，其氣必虛“等，都論證了這一點。
3.病變:疾病的變化是復雜的，《黃帝內經》概括病變也是多方面的，有從陰陽來概括的，用表里中外歸納的，用寒熱歸納的，從虛實而論者，實指邪氣盛，虛指正氣衰。概括說來，有正虛而邪實者，有邪實而正不虛者，有正虛而無實邪者，有正不虛而邪不實者。
折疊診法學說
望聞問切四診源于《黃帝內經》。
1.望診:包括觀神色、察形態、辨舌苔。
觀神色者，如《靈樞·五色》、《靈樞·五閱五使》和《靈樞·五色》所載，這些在臨床上都很有意義。
察形態者，是察看人的骨肉皮膚而推斷病情，在臨床上虛實是錯綜復雜的，只有知其常，才能達其變。
辨舌苔者，如《素問·熱論》、《素問·刺熱論》和《靈樞》所載等等。
2.聞診:包括聞聲和嗅氣味。
聞聲音者，是聽患者的聲音而診斷病情。
其次是嗅氣味，如《素問·金匱真言論》所說，肝病其臭臊，心病其臭焦，脾病其臭香，肺病其臭腥，腎病其臭腐。
3.問診:問訊患者的自覺癥狀，以診斷病情。
4.切診:包括切脈與切膚。《黃帝內經》言切脈最詳，主要為:
(1)三部九候法:即分頭手足三部，每部分天地人三候。
(2)人迎寸口脈法:即兼診人迎和寸口兩處之脈，互相比較。
(3)調息法:即調醫者之呼吸，診病人之脈候。
(4)謂胃氣脈:脈象之中有無胃氣，至關重要，有胃氣則生，無胃氣則死。
(5呼吸，診病人之脈候。
(4)謂胃氣脈:脈象之中有無胃氣，至關重要，有