卷五，脈要精微論篇第十七，平人氣象論篇第十八。
卷六，玉機真藏論篇第十九，三部九候論篇第二十。
卷七，經脈別論篇第二十一，藏氣法時論篇第二十二，宣明五氣篇第二十三，血氣形志篇第二十四。
卷八，寶命全形論篇第二十五，八正神明論篇第二十六，離合真邪論篇第二十七，通評虛實論篇第二十八，太陰陽明論篇第二十九，陽明脈解篇第三十。
卷九，熱論篇第三十一，刺熱篇第三十二，評熱病論篇第三十三，逆調論篇第三十四。
卷十，瘧論篇第三十五，刺瘧篇第三十六，氣厥論篇第三十七，咳論篇第三十八。
卷十一，舉痛論篇第三十九，腹中論篇第四十，刺腰痛篇第四十一。
卷十二，風論篇第四十二，痹論篇第四十三，痿論篇第四十四，厥論篇第四十五。
卷十三，病能論篇第四十六，奇病論篇第四十七，大奇論篇第四十八，脈解篇第四十九。
卷十四，刺要論篇第五十，刺齊論篇第五十一，刺禁論篇第五十二，刺志論篇第五十三，針解篇第五十四，長刺節論篇第五十五。
卷十五，皮部論篇第五十六，經絡論篇第五十七，氣穴論篇第五十八，氣府論篇第五十九。
卷十六，骨空論篇第六十，水熱穴論篇第六十一。
卷十七，調經論篇第六十二。
卷十八，繆刺論篇第六十三，四時刺逆從論篇第六十四，標本病傳論篇第六十五。
卷十九，天元紀大論篇第六十六，五運行大論篇第六十七，六微旨大論篇第六十八。
卷二十，氣交變大論篇第六十九，五常政大論篇第七十。
卷二十一，六元正經大論篇第七十一，刺法論篇第七十二(遺篇)，本病論篇第七十三(遺篇)。
卷二十二，至真要大論篇第七十四。
卷二十三，著至教論篇第七十五，示從容論篇第七十六，疏五過論篇第七十七，徵四失論篇第七十八。
卷二十四，陰陽類論篇第七十九，方盛衰論篇第八十，解精微論篇第八十一。
折疊靈樞目錄
卷一、九針十二原第一，本輸第二，小針解第三，邪氣藏府病形第四。
卷二、根結第五，壽夭剛柔第六，官針第七，本神第八，終始第九。